또 해양경찰청과 소방청을 신설하고 미래창조과학부 명칭을 과학기술정보통신부로 바꾸며 산하에 과학기술 정책을 주도하는 차관급 과학혁신본부를 설치한다. 국가보훈처장 지위를 장관급으로 격상하며 장관급 대통령 경호실을 차관급인 대통령 경호처로 개편한다. 산업통상자원부에 차관급 통상교섭본부를 설치한다.
이번 개정안에는 부대의견으로 중소벤처기업부에 소상공인 담당실을 신설하도록 했으며 우정사업본부의 우정청 승격과 보건복지부 2차관제 도입 문제는 2차 정부조직 개편 때 적극 협의해 처리토록 했다.
여야는 이번 개정안과 별개로 환경부로 물관리를 일원화하는 방안은 국회 해당 상임위원회에서 특위를 꾸려 9월 말까지 더 논의키로 했다. 또 국회는 이날 정부조직 개편에 따라 국회 상임위 이름을 바꾸는 국회법 개정안도 처리했다.